Για να κάνει οικεία, προσιτή και ανοιχτή την Ομοιοπαθητική σε όλους ανεξαιρέτως τους γιατρούς, η ΕΕΟΙΣ παρέχει, για εικοστό δεύτερο συνεχή χρόνο το πλήρες εκπαιδευτικό πρόγραμμά της, το οποίο περιλαμβάνει: α) θεωρητικό σκέλος με ζωντανή διδασκαλία και χρήση όλων των οπτικοακουστικών μέσων και β) σκέλος πρακτικής εφαρμογής.

Το εκπαιδευτικό πρόγραμμα της ΕΕΟΙΣ υπερβαίνει όλες τις προδιαγραφές της Διεθνούς Συνδέσμου Ομοιοπαθητικής Ιατρικής (L.I.G.A) και της Ευρωπαϊκής Επιτροπής Ομοιοπαθητικής (European Committee for Homeopathy, ECH) και είναι πιστοποιημένο από την τελευταία. Μάλιστα, Η ΕΕΟΙΣ είναι η πρώτη εταιρεία στην Ελλάδα -και μεταξύ των τριών πρώτων πανευρωπαϊκώς- που πιστοποιήθηκε από την ECH να χορηγεί ευρωπαϊκό δίπλωμα ομοιοπαθητικής (European diploma of Homeopathy).

Επιπλέον, για τη διαρκή μετεκπαίδευση των ομοιοπαθητικών, η ΕΕΟΙΣ διοργανώνει ανελλιπώς, σε τακτική μηνιαία βάση το μετεκπαιδευτικό πρόγραμμα των "Ομοιοπαθητικών Διαλόγων" (ΟΜ-ΔΙΑ). To μοναδικό αυτό μετεκπαιδευτικό πρόγραμμα, έχει καταστεί ευρέως γνωστό και δημοφιλές στους Έλληνες Ομοιοπαθητικούς, συνεισφέροντας καθοριστικά στη βελτίωση της περίθαλψης των ασθενών τους.

Η ΕΕΟΙΣ πέραν του εκπαιδευτικού της έργου, προωθεί την επιστημονική και έγκυρη ενημέρωση των λοιπών επαγγελματιών υγείας για το θεραπευτικό σύστημα της Ομοιοπαθητικής Ιατρικής καθώς και την αντίστοιχη ενημέρωση του κοινού μέσω εντύπων, εκπομπών και διαλέξεων. Ακόμα, αναλαμβάνει πρωτοβουλίες σχετικά με την επιστημονική έρευνα στην Ομοιοπαθητική και επίσης, υποστηρίζει και εκπροσωπεί σε όλα τα αρμόδια όργανα της πολιτείας και στους Ιατρικούς Συλλόγους τους γιατρούς-μέλη της.